Introducción al análisis de la expresión génica mediante secuenciación masiva (RNA-SEQ)

Introducción al análisis de la expresión génica mediante secuenciación masiva (RNA-SEQ)

En la era de las ómicas, las tecnologías de secuenciación masiva (Next Generation Sequencing, NGS) permiten el análisis de sistemas complejos a nivel celular. Este curso va dirigido a estudiantes que quieran profundizar en el potencial de este tipo de tecnologías en los estudios de expresión génica frente a distintos factores, englobando tanto el ámbito agropecuario como el ámbito clínico.

En el primer módulo introduciremos los mecanismos implicados en la regulación génica. El segundo módulo versará sobre la forma en la que se estudiaban estos mecanismos antes de la introducción de la NGS, y cómo éstos han ido evolucionando hacia técnicas más masivas. En los siguientes módulos se realizará una aproximación a las técnicas de análisis de expresión génica mediante NGS, las denominadas RNA-seq, que engloban desde el análisis de RNA codificantes de proteínas hasta los análisis de RNA reguladores. Por otro lado, introduciremos los distintos tipos de análisis bioinformáticos encaminados a la obtención de conocimiento biológico a partir de estos datos.

Por último, y como máxima novedad, hablaremos de cómo estás técnicas se están dirigiendo a los análisis de célula única, un tema de vital importancia en enfermedades como el cáncer. El interés académico radica en el aprendizaje de una técnica que está cada vez más en uso, así como el conocimiento de nuevas tecnologías para su análisis.

Dirigido a estudiantes, docentes y profesionales de cualquier área del conocimiento médico y de las ciencias técnicas y experimentales. Especialmente enfocado para graduados/licenciados en Biología, Bioquímica, CC. Ambientales, Medicina, Química, Farmacia, Enfermería, Ingenierías de la salud, así como técnicos de laboratorio (FP grado medio y superior en técnico de laboratorio y análisis clínicos).

Nivel básico

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• PROGRAMA
• Bloque 1: Mecanismos de regulación génica y procesamiento de muestras en el laboratorio.
• Bloque 2: Análisis de expresión génica espacial y de célula única.
• Bloque 3: Análisis de expresión génica previo a la implantación de las tecnologías de nueva generación.
• Bloque 4: Introducción a las tecnologías de secuenciación masiva.
• Bloque 5: Secuenciación masiva mediante RNA-seq.
• Bloque 6: Análisis bioinformático de datos de RNA-seq.

• DOCENTE
• Silvana Teresa Tapia Paniagua. Dpto. Microbiología, UMA
• Belén Delgado Martín, Unidad de Bioinformática, UMA
• Isabel María Cerezo Ortega, Centro de Bioinnovación y Supercomputación, UMA
• Josefa Gómez Maldonado, Centro de Bioinnovación (SCBI-SCAI), UMA
• Alicia Jiménez Valadez, Unidad de Genómica y Ultrasecuenciación (SCAI-SCBI), UMA